杜鵑颱風台南市災害應變中心於9月28日9時二級開設，本區同步成立災害應變中心二級開設，籲請民眾避免前往海邊從事釣魚、戲水及觀浪等危險活動。曾文水庫自本日(9/28)11時起作調節性放水，合計放水每秒100立方公尺，請民眾注意安全遠離曾文溪河床。